يُعد قسم هندسة تكرير النفط والغاز، الذي حصل على الاعتماد الرسمي في ٣٠ أيلول ٢٠٢٥، من الأقسام الرائدة في كلية الهندسة بجامعة الكتاب. يتخصص في تدريب مهندسين وكوادر تقنية مؤهلة لتصميم وتطوير وتشغيل أنظمة تكرير النفط والغاز. يركز البرنامج على المهارات العملية في عمليات التكرير البترولي، التكنولوجيا البتروكيميائية، تصميم المصانع وتحسينها، صيانة المعدات، والإدارة البيئية في المصافي. يقدّم القسم مناهج متكاملة تدمج المعرفة النظرية مع التدريب المخبري والميداني المكثّف، مما يمكن الطلبة من إجراء أبحاث عمليات التكرير، وتحسين عمليات الإنتاج، وتنفيذ حلول تكرير متقدمة عبر قطاع الطاقة. يتعاون القسم بشكل وثيق مع شركات النفط والجهات الحكومية المعنية بالطاقة والمؤسسات البحثية لتوفير خبرة عملية حقيقية للطلبة. يدعم القسم مختبرات محاكاة متقدمة للمصافي ويشرف عليه هيئة متميزة من الأكاديميين والخبراء التقنيين في هندسة تكرير النفط.